Курс всеобщей истории: т. 1-2. — Пг.; Л.: Рабочее издательство «Прибой», 1923‒25
История Древнего мира / Гос. акад. истории материал. культуры им. Н. Я. Марра; под ред. С. И. Ковалева. — ММ.: Соцэкгиз, 1936
История античного общества: Греция. Эллинизм. Рим / Ленингр. гос. ун-т им. А. С. Бубнова, Ист. фак. — ч. 1 «Греция», ч. 2 «Эллинизм. Рим». — ММ.-Л.: Соцэкгиз, Ленинградское отделение, 1936
История античного общества: Греция. Эллинизм. Рим / Ленингр. гос. ун-т им. А. С. Бубнова, Ист. фак. — 2-е, испр. изд. — ч. 1 «Греция», ч. 2 «Эллинизм. Рим». — ММ.-Л.: Соцэкгиз, Ленинградское отделение, 1937
История Рима: курс лекций. — Л.: Изд-во Ленинградского государственного ордена Ленина университета, 1948
История древнего мира: Учебник для 5-6 классов средней школы. — ММ.: Учпедгиз, 1954
История древнего мира: Учебник для 5-6 классов средней школы. — 2-е изд. — ММ.: Учпедгиз, 1955
Очерки истории древнего Рима: пособие для учителей. — ММ.: Учпедгиз, 1956 (Совместно с Е. М. Штаерман)
Мәҡәләләре һәм монографиялары:
Македонская оппозиция в армии Александра // Изд-во Ленинградского университета, т. II, 1930, — С. 148—183
Учение Маркса и Энгельса об античном способе производства. — Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1932 — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; т. XII, вып. 9—10)
Об основных проблемах рабовладельческой формации. — Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1933. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 64)
Античный способ производства в источниках: литературные, эпиграфические и папирологические свидетельства о социально-экономической истории древней Греции, эллинистического Востока и Рима. — Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1933. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 78) (Совместно с С. А. Жебелевым)
Об основных проблемах рабовладельческой формации. — Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1933. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 64)
Классовая борьба и падение античного общества. // Из истории докапиталистических формаций. — ММ.—Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1933. — С. 345—354. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 100)
Проблема социальной революции в античном обществе. // К. Маркс и проблемы истории докапиталистических формаций. — ММ.—Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1934. — C. 295—328. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 90)
Экономика античного общества. // Краткое введение в историю докапиталистических формаций. — ММ.—Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1934. — С. 89—99. — (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 99)
Великие восстания рабов II—I вв. до н. э. в Риме. // Из истории античного общества. — ММ.—Л.: Изд-во Государственной академии истории материальной культуры, 1934. — С. 139—180.— (Известия Государственной академии истории материальной культуры; вып. 101) (Совместно с С. А. Жебелевым)
О некоторых проблемах рабовладельческой формации. // Проблемы истории докапиталистических обществ, 1934, № 2, — С. 70—80
Александр Македонский. — Л.: Гос. соц-экон. изд-во, 1937
Переговоры Дария с Александром и македонская оппозиция. // Вестник древней истории, 1946, № 3. — С. 46-56
Две проблемы римской истории. // Вести Ленинградского университета, 1947, № 4. — С. 86-98
Проблема происхождения патрициев и плебеев. // Труды юбилейной научной сессии [Ленинградского университета]. Секция ист. наук. — Л., 1948, — С. 202—244;
Происхождение христианства. — Л., 1948
Заговор «пажей» // Вестник древней истории, 1948, № 1. — С. 34—42
Исторический научно-исследовательский институт ЛГУ. // Вестник древней истории, 1948, № 1. — С. 177—178
Александр и Клит. // Вестник древней истории, 1949, № 3. — С. 69—73
Монархия Александра Македонского. // Вестник древней истории, 1949, № 4. — С. 29—40
Александр, Филота и Парменион. // Учен. зап. ЛГУ, № 112, серия ист., 1949, вып. 4. — С. 280—308
Эллинистическая цивилизация. — ММ.: Изд-во иностранной лит-ры, 1949 (Совместно с У. В. Тарном)
Происхождение и классовая сущность христианства: стенограмма публ. лекции. — Л.: Всесоюзное общество по распространению политических и научных знаний, Ленингр. отд-ние, 1951
Происхождение и классовая сущность христианства. — Л.: Всесоюзное общество по распространению политических и научных знаний, Ленингр. отд-ние, 1952
Миф об Иисусе Христе. — Л.: Всесоюзное общество по распространению политических и научных знаний. Ленинградское отделение, 1954
К вопросу о характере социального переворота III—V вв. в западной Римской империи. // Вестник древней истории, 1954, № 3. — С. 33—44.
Опыт периодизации римской истории. // Вестник древней истории, 1955, № 4. — С. 108—116
К вопросу о датировке начала восстания Спартака. // Вестник древней истории, 1956. № 2. — С. 12—17
Сорок лет советской историографии по древнему Риму. // Вестник древней истории, 1957, № 3. — C. 42-54
Основные вопросы происхождения христианства. // Ежегодник Музея истории религии и атеизма, т. II, 1958. — C. 3—25
Из истории критики христианства (мифологическая школа). // Ежегодник Музея истории религии и атеизма, т. III, 1959. — C. 46—61
История папства и инквизиции: краткий справочник-путеводитель. — ММ.: Изд-во Академии наук СССР, 1959
Основные вопросы происхождения христианства. — ММ.—Л.: Наука, Государственный музей истории религии и атеизма АН СССР, 1964 (Совместно с В. В. Струве)
Находки в Иудейской пустыне: открытия в районе Мертвого моря и вопросы происхождения христианства. — ММ.: Госполитиздат, 1960 (Совместно с М. М. Кублановым)
Находки в Иудейской пустыне: открытия в районе Мертвого моря и вопросы происхождения христианства. — 2-е изд., перераб. и доп. — ММ.: Политиздат, 1964 (Совместно с М. М. Кублановым)
Причины возникновения христианства. // Вестник древней истории, 1962, № 3. — C. 78—95
К 70-летию со дня рождения проф. С. И. Ковалева. // Вестник древней истории, 1956, № 3. — С. 158—159
Профессор Сергей Иванович Ковалев (1886—1960 гг.). [Некролог]. // Вестник древней истории, 1960, № 4. — С. 249
Колобова К. М., Профессор С. И. Ковалёв (1886—1960) // Ежегодник Музея истории религии и атеизма: сборник, т. V. — ММ.—Л., 1961. — С. 358—375 (библиография работ С. И. Ковалёва)
Ботвинник М. Н.Ковалёв Сергей Иванович. // Большая советская энциклопедия. — ММ.: Советская энциклопедия, 1969—1978. — Т. 12: Кварнер — Коигур.
Фролов Э. Д.С. И. Ковалев и его «История Рима» // Ковалев С. И. История Рима. — Л.: Издательство ЛГУ, 1986. — С. 3-16 (подробная библиография о С. И. Ковалёве)
КОВАЛЁВ Сер. Ив.(недоступная ссылка) // Российский гуманитарный энциклопедический словарь: В 3 т. — М: Гуманит. изд. центр ВЛАДОС: Филол. фак. С.-Петерб. гос. ун-та, 2002. — Т. 2: З—О. — 720 с.: ил.
Ковалёв, Сергей Иванович. // Лисовый И. А., Ревяко К. А., Античный мир в терминах, именах и названиях: Словарь-справочник по истории и культуре Древней Греции и Рима / Науч. ред. А. И. Немировский. — 3-е изд. — Мн.: Беларусь, 2001;